Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms