Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms