Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms