Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NESP48681 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NESP48681 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NESP48681 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NESP48681 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NESP48681 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms