Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR1P43307 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR1P43307 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR1P43307 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR1P43307 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms