Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJB2P29033 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms