Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCNA2P20248 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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