Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC175P0C221 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms