Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNN4O15554 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms