Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms