Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HDAC6Q9UBN7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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