Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNPPD1Q9BV87 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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