Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms