Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms