Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms