Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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CCDC142Q17RM4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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CCDC142Q17RM4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CCDC142Q17RM4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CCDC142Q17RM4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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