Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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