Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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