Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms