Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms