Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms