Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL137802.2-201ENST00000562878 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms