Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJC1P36383 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJC1P36383 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJC1P36383 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJC1P36383 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJC1P36383 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJC1P36383 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJC1P36383 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms