Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC27P30260 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC27P30260 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms