Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF3P18847 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms