Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCP1P17987 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms