Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms