Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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