Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms