Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLKQ9UBT6 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms