Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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