Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms