Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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