Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms