Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms