Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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