Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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HERC3Q15034 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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