Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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FOXF1Q12946 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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