Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms