Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms