Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMF1P82094 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms