Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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