Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms