Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GSK3BP49841 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms