Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSR1P43307 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms