Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID4AP29374 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 440 ms