Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A1P19634 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms