Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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