Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms