Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms